На главную страницу первого семестра

Изображение области связывания ISOCITRATE c белком IDH_ECOLI

Область связывания была выделена с помощью программы RasMol и команды "within", которая отображает аминокислотные остатки белка, находящиеся на расстоянии 3,5 Å от лиганда. Лиганд ISA изображён в проволочной модели, крупнее чем все остальные группы. Между атомами азота и кислорода показана водородная связь,которая изображена в виде красно-синих "палочек", соединяющих соответствующие атомы. В мелком маcштабе показаны аминокислотные остатки белка, которые взаимодействуют с лигандом. Эти остатки играют немаловажную роль в удержании лиганда, поэтому именно они были предложены мной в генно-инженерном проекте.

Проект генно-инженерного эксперимента.

С лигандом взаимодействуют следующие остатки: 103, 113, 115, 116, 119, 129, 153, 160, 307, 311, 336.
Замена 1: Замена аспарагина311 на фенилаланин приведет к потере устойчивости структуры.
Замена 2: Замена аргинина119 на лизин не приведёт к потере устойчивости структуры.
Первая замена правомерна т.к. фенилаланин нейтрально заряжен.
Вторая замена правомерна т.к. лизин заряжен также как аргинин.
© Волкова Екатерина,2004